Supertajna amerykańska baza wojskowa na pustyni Nevada, zwana Strefą 51, należy do najlepiej strzeżonych obszarów wewnątrz terytorium Stanów Zjednoczonych. Liczne teorie spiskowe, jakie narodziły się krótko po jej powstaniu, mówią o przetrzymywaniu tam pozaziemskich form życia i rozbitych statków UFO, o eksperymentach z nowymi rodzajami broni, jak np. broń meteorologiczna. Na początku lat 50. z rozkazu prezydenta Trumana na terenie Strefy ukryto Bibliotekę – księgozbiór o kluczowym znaczeniu dla współczesnego świata, odnaleziony w 1947 roku na brytyjskiej wyspie Wight. Na odręcznie spisanych stronicach mnisi z opactwa Vectis umieścili daty narodzin i śmierci wszystkich ludzi na Ziemi, aż do roku 2027. Dzięki tej wiedzy rząd USA może prognozować najważniejsze wydarzenia światowe, co daje mu przewagę strategiczną nad wrogami Ameryki. O istnieniu Biblioteki wie jedynie garstka ludzi; agenci Strefy, przy użyciu wszelkich dostępnych środków, z zabójstwami włącznie, dbają o to, by informacja ta nigdy nie ujrzała światła dziennego. Agent FBI, Will Piper, poznał w trakcie prowadzonego dochodzenia sekret Biblioteki i nieomal zapłacił za to życiem.

Od tamtych wydarzeń (opisanych w powieści „Biblioteka umarłych”) minęło kilka lat. Na aukcji w Londynie pojawia się zaginiona przed wiekami, pochodząca z Biblioteki księga z 1527 roku. W imieniu milionera Henry’ego Spence’a, byłego analityka Strefy, Will kupuje pokaźne tomiszcze. Okazuje się, że pod wyklejką okładki ukryto pergamin z wykaligrafowanym sonetem, podpisanym przez samego WilliamaSzekspira. Zawiera on wskazówki dotyczące pochodzenia księgi „dusz”, która – co wkrótce wychodzi na jaw – w istotny sposób wpłynęła na historię ludzkości, inspirując takich ludzi jak m.in. teolog Jan Kalwin (Jean Cauvin) i Nostradamus – lekarz, astrolog i jasnowidz, autor słynnych proroctw. Księgę oraz inne odnalezione przez Willa dokumenty próbują przechwycić agenci Strefy; na polecenie najwyższych czynników rządowych Piper i jego żona mają być zlikwidowani…