Joel jest zdruzgotany kiedy dowiaduje się, że jego dziewczyna, Clementine, wymazała z pamięci wszystkie wspomnienia z ich wspólnego, bardzo burzliwego związku. W akcie desperacji Joel kontaktuje się z doktorem Howardem Mierzwiakiem, który przeprowadził zabieg u Clementine. Prosi go aby wymazał z jego pamięci wszystkie wspomnienia związane z narzeczoną. W czasie jak wspomnienia stopniowo zanikają, Joel zaczyna odkrywać pasję, która łączyła go z Clementine na początku związku. Joel zaczyna zdawać sobie sprawę, że wcale nie chce zapominać o swojej dziewczynie i aby przerwać rozpoczęty przez doktora Mierzwiaka proces, zaczyna przenosić wspomnienia o Clementine do tych części swojego mózgu, w których wcale nie powinno ich być.